Η έντονη βροχόπτωση και χαλαζόπτωση στην ευρύτερη περιοχή της Σαντορίνης και τα φερτά υλικά από όμορα ρέματα του οδικού δικτύου με τις εγκαταστάσεις του αεροδρόμιου, εμπόδισαν τη σωστή λειτουργία των υποδομών αποστράγγισης, παρόλο που ήταν σε άριστη κατάσταση. Η Fraport Greece και τα στελέχη της με υπεράνθρωπες προσπάθειες κατάφεραν να διατηρήσουν την απρόσκοπτη εκτέλεση του πτητικού προγράμματος μέσω της άμεσης ενεργοποίησης του σχεδίου που προβλέπεται σε έκτακτες ανάγκες, ενώ η ομάδα της εταιρείας διαχείρισης είναι επιτόπου ώστε να επέμβει ξανά αν παραστεί ανάγκη.